Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3102622	3102668	47	30 [0]	[0] 4	mutY	adenine DNA glycosylase

ACTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAGG  >  W3110S.gb/3102561‑3102621                                                             | aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:2451972/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:982759/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:887495/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:743028/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:675211/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:547106/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:406014/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:399408/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:377287/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:338211/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:334447/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:2798968/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:2573633/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:2539646/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1067318/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:2360952/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:2320980/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:221135/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:2170887/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:2098648/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1793633/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:169641/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1593145/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1381776/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1291841/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1276205/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1190789/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1173488/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:1139098/61‑1 (MQ=255) aCTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCACGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAgg  <  1:324858/61‑1 (MQ=255)                                                             | ACTTAGATATTGTGCCTATGTGGCTTCCCGTGTCGTCATTCACCGGCTGCATGGATGAAGG  >  W3110S.gb/3102561‑3102621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑