Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	115619	115648	30	17 [0]	[0] 11	hofC	assembly protein in type IV pilin biogenesis, transmembrane protein

CGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCT  >  W3110S.gb/115558‑115618                                                             | cgacACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:1626293/58‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTGACCATCTGTTGCt  <  1:692301/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACTATCTGTTGCt  <  1:2281063/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:2245619/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:999811/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:809597/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:393898/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:384299/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:2556210/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:2315069/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:1087707/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:2089423/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:1999859/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:1816920/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:1456187/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:1435518/61‑1 (MQ=255) cGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCt  <  1:1423733/61‑1 (MQ=255)                                                             | CGCCACTGCGCAGAATTGATGGCGATTCGCTTCAGGCTTAGTGGGGTAACCATCTGTTGCT  >  W3110S.gb/115558‑115618

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑