Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3169237	3169273	37	22 [0]	[0] 9	qseC	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with QseB

CCTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCT  >  W3110S.gb/3169201‑3169236                                    | ccTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:2048647/36‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:2410686/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:894633/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:740674/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:602033/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:479834/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:448902/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:392009/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:338956/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:324170/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:2458788/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1144212/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:2083828/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1988865/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1948368/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1562373/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1466727/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1432314/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1401504/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1382125/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:1261315/35‑1 (MQ=255)  cTCGGTAACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCt  <  1:549033/35‑1 (MQ=255)                                    | CCTCGGTGACCTGGCTGCTTTCCAGCTTTGTCGCCT  >  W3110S.gb/3169201‑3169236

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑