Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3287882	3287891	10	58 [0]	[0] 15	yraH/yraI	predicted fimbrial‑like adhesin protein/predicted periplasmic pilin chaperone

GTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAT  >  W3110S.gb/3287839‑3287881                                           | gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:433125/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1084072/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2637625/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2645232/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:265002/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2651557/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:270446/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2720336/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2846975/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2861108/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2897280/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2913099/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2915333/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:424515/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2635641/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:554214/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:564372/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:579105/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:600522/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:606997/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:648256/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:652093/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:652750/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:672784/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:673254/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:829710/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:861815/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:999135/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1818180/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1125661/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1194848/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1288954/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1317103/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1329321/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1341661/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1427556/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1434122/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1452341/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1537506/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1606464/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1651128/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1740761/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2631859/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:1903636/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2055669/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2059594/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:207235/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2104578/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2226004/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2245938/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:229963/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2321518/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2332353/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:238499/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2464875/43‑1 (MQ=255) gTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2472197/43‑1 (MQ=255)  ttAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:2864647/42‑1 (MQ=255)  ttAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAt  <  1:930870/42‑1 (MQ=255)                                           | GTTAACGTAACGCTGGATTACCGTTAATACGTTAGGGCGTTAT  >  W3110S.gb/3287839‑3287881

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑