Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3289754	3289778	25	32 [0]	[0] 17	yraJ	predicted outer membrane protein

TCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCG  >  W3110S.gb/3289712‑3289753                                          | tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2330558/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:885513/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:767020/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:697350/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:650824/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:608745/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:393307/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:376647/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:304303/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2820688/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2538291/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2493036/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2456941/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2391378/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2335083/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2332517/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1035573/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2227736/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:2169751/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1988746/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1909927/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1881785/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1842275/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1822820/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:180029/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1736840/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1729899/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1681511/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1640725/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:142473/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1169375/1‑42 (MQ=255) tCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCg  >  1:1042156/1‑42 (MQ=255)                                          | TCGCTTTATCCAGCCTTATTCTTCATTACCCATGATGCAGCG  >  W3110S.gb/3289712‑3289753

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑