Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3289918	3289935	18	22 [0]	[0] 31	yraJ	predicted outer membrane protein

TTGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTGG  >  W3110S.gb/3289857‑3289917                                                             | ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:2017560/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:892019/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:873776/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:812960/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:628873/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:594765/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:390471/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:28340/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:2825225/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:2681928/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1007256/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:2005664/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1976145/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1963578/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1852644/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1749088/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1595965/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:125097/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1116264/61‑1 (MQ=255) ttGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1017416/61‑1 (MQ=255)  tGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:2874247/60‑1 (MQ=255)  tGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTgg  <  1:1383191/60‑1 (MQ=255)                                                             | TTGAATAATACTTTTACGCTGTATGGCGGCCTGCTCGGTTCTGAAGATTATTATGCGCTGG  >  W3110S.gb/3289857‑3289917

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑