Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3290930	3290931	2	18 [0]	[0] 31	yraJ	predicted outer membrane protein

CAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTA  >  W3110S.gb/3290868‑3290929                                                              | caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:2343637/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:887326/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:837580/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:749789/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:661656/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:653650/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:536564/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:509116/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:2490628/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:1108562/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:215036/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:2083641/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:199309/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:1808972/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:1737236/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:1350099/62‑1 (MQ=255) caGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:1338827/62‑1 (MQ=255)  aGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTa  <  1:2174388/61‑1 (MQ=255)                                                              | CAGTTTGTGGTGCCCAACAGAGGTGCAATGGTAGCGGCGCGTTTCAACGCCAATATCGGTTA  >  W3110S.gb/3290868‑3290929

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑