Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3345061	3345083	23	15 [0]	[0] 15	rpoN	RNA polymerase, sigma 54 (sigma N) factor

CTATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGAA  >  W3110S.gb/3344999‑3345060                                                              | ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:1123576/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:1232349/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:1245217/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:1290676/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:1876580/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:1950827/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:210074/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:2266740/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:2485429/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:2491739/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:251982/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:319288/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:505078/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:546546/1‑62 (MQ=255) ctATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGaa  >  1:990417/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTATCGTCGATGCCGTTGATGAAACCGGTTATCTGACTGTCCCGCTGGAAGATATTCTCGAA  >  W3110S.gb/3344999‑3345060

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑