Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3377464	3377531	68	38 [0]	[0] 4	sspA/rpsI	stringent starvation protein A/30S ribosomal subunit protein S9

GACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGA  >  W3110S.gb/3377402‑3377463                                                              | gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCATATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:376732/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2506202/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1019910/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2364993/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:238129/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:238709/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2407886/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:240957/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2409832/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2412620/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:249153/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2361912/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2589201/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2602006/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2766450/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:602046/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:733883/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:807913/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:871401/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1828379/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1036762/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1409687/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1640766/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1655187/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1684904/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1735489/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2358803/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1845712/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1848816/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1858451/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1893366/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1979544/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2193741/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2201621/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:2245197/62‑1 (MQ=255) gACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGAGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:487384/62‑1 (MQ=255)  aCATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1650124/61‑1 (MQ=255)     tttGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGa  <  1:1454685/58‑1 (MQ=255)                                                              | GACATTTGGGCAGAAAATTGGATGATAGTTTACCAGATTTTGCGACCATTGTGGTGAGTCGA  >  W3110S.gb/3377402‑3377463

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑