Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3390095	3390188	94	16 [0]	[0] 11	aaeR	predicted DNA‑binding transcriptional regulator, efflux system

TAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCG  >  W3110S.gb/3390034‑3390094                                                             | tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:1033256/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:1039685/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:1282825/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:1292017/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:1587793/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:1676620/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:2361824/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:2748301/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:2896641/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:379061/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:631227/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:684523/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:766229/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:834852/61‑1 (MQ=255) tAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:930597/61‑1 (MQ=255)    tGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCg  <  1:353990/58‑1 (MQ=255)                                                             | TAATGATCCGATGACGCTGGTGCGCTGGCTGACGGCGGGTGCCGGGATCGCCTACGTGCCG  >  W3110S.gb/3390034‑3390094

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑