Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3390313	3390367	55	30 [0]	[0] 2	aaeR/tldD	predicted DNA‑binding transcriptional regulator, efflux system/predicted peptidase

TTGAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATATT  >  W3110S.gb/3390252‑3390312                                                             | ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2116080/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:997507/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:915843/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:89079/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:749429/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:695377/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:606702/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:572838/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:295150/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:294253/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2779198/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2726334/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2606402/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2398276/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:213199/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1216166/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2102773/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2097546/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2055678/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1995290/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1976755/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1737131/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1642968/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1536983/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1440053/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1416881/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1398792/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1371963/61‑1 (MQ=255) ttgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:1289287/61‑1 (MQ=255)  tgAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATAtt  <  1:2051446/60‑1 (MQ=255)                                                             | TTGAGGTCGGTAAATTGTTTCAGGAGATGCACGGGCGCGGGAAAGAGAAGTAATTCATATT  >  W3110S.gb/3390252‑3390312

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑