Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3416123	3416126	4	36 [0]	[0] 20	acrF	multidrug efflux system protein

ACACTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGT  >  W3110S.gb/3416061‑3416122                                                              | acacTAACGATGTTCTGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:889489/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2692291/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1094314/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2409950/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2436456/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2439798/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2541261/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2564106/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2676578/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2688311/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2407469/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:271390/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2750418/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2798979/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2848489/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:460218/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:914716/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:93953/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:167502/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1102336/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1121825/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1216672/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1300253/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1418867/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1436652/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1445858/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:219304/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1745650/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1778240/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1875501/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1948364/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:198543/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:1990326/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2000468/62‑1 (MQ=255) acacTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:2079528/62‑1 (MQ=255) acacTAACCATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAgtggt  <  1:814672/62‑1 (MQ=255)                                                              | ACACTAACGATGTTCGGGATGGTGCTTGCCATCGGGCTGCTCGTCGATGATGCGATAGTGGT  >  W3110S.gb/3416061‑3416122

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑