Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3454913	3454915	3	35 [0]	[0] 4	rpoB	RNA polymerase, beta subunit

CGAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATA  >  W3110S.gb/3454851‑3454912                                                              | cgAACTGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1609423/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGATGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2803925/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2428641/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1255296/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2451750/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2640821/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2706625/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2786111/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2830626/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2875205/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:30305/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:33258/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:653962/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:742938/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:810944/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:924839/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:965456/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:976938/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1611345/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1077846/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:128904/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1313431/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1385653/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1470928/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1480442/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1562972/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:2378204/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1745744/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1800929/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1817991/62‑1 (MQ=255) cgAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1862532/62‑1 (MQ=255)       ggTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:191115/56‑1 (MQ=255)           gTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1680596/52‑1 (MQ=255)                  ggATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:166863/45‑1 (MQ=255)                           tCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATa  <  1:1277830/36‑1 (MQ=255)                                                              | CGAACAGGTTGTCCTTCGGATCGAATTCGAAGTCCAGCCAGGAACCACGGTAAGGGATGATA  >  W3110S.gb/3454851‑3454912

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑