Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3493597	3493631	35	12 [0]	[0] 34	frwC	predicted enzyme IIC component of PTS

CACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAG  >  W3110S.gb/3493555‑3493596                                          | cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:1267795/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:1278765/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:1384573/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:2617607/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:277656/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:2908846/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:37087/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:487895/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:586609/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:891042/42‑1 (MQ=255) cACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:919516/42‑1 (MQ=255)  aCTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAg  <  1:765000/41‑1 (MQ=255)                                          | CACTTTGTTAACCGGACCGCCCATATCGAACGCCAGCATCAG  >  W3110S.gb/3493555‑3493596

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑