Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3499225	3499242	18	30 [0]	[0] 38	yijF	conserved hypothetical protein

TTGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGTT  >  W3110S.gb/3499163‑3499224                                                              | ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2445401/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:950501/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:947061/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:830296/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:544723/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:49890/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:426600/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:313614/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2790120/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2690349/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2551248/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2514851/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:1132899/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2377130/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2253412/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2223424/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2047257/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:190881/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:1893343/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:1763454/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:1676757/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:1622882/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:1586726/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:1445212/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:136869/62‑1 (MQ=255) ttGGCAGCACCCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2034890/62‑1 (MQ=255)  tGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2882817/61‑1 (MQ=255)  tGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:748513/61‑1 (MQ=255)         aCGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:1173984/54‑1 (MQ=255)                       tCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGtt  <  1:2753258/40‑1 (MQ=255)                                                              | TTGGCAGCACGCTATTTTACGATCCGGCGTATGTGCAGCTTACTTATCCTGGCGGTGATGTT  >  W3110S.gb/3499163‑3499224

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑