Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3537864	3537917	54	17 [0]	[0] 4	rhaR	DNA‑binding transcriptional activator, L‑rhamnose‑binding

GGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAT  >  W3110S.gb/3537802‑3537863                                                              | ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:2429010/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:846045/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:764366/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:761747/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:2600579/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:2534009/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:1239315/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:2393603/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:2300112/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:1996450/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:1975106/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:1971797/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:1607326/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:1571956/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGAGTAATGCGAt  <  1:2531725/62‑1 (MQ=255) ggAAGCGGAGGAGTGTTTATCATCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:2820054/62‑1 (MQ=255)                    tCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAt  <  1:711370/43‑1 (MQ=255)                                                              | GGAAGCGTAGGAGTGTTTATCGTCAGCATGAATGTAAAAGAGATCGCCACGGGTAATGCGAT  >  W3110S.gb/3537802‑3537863

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑