Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3612086	3612098	13	26 [0]	[0] 5	rfaH	DNA‑binding transcriptional antiterminator

TTTGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCA  >  W3110S.gb/3612025‑3612085                                                             | tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAATGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1499795/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1159395/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:949900/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:803337/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:660805/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:517137/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:434278/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:378804/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:2899149/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:2875550/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:276132/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:2633957/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:253709/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:2494749/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:2063589/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1821077/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1813402/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1712491/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1414119/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1348873/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1333785/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1306028/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1174694/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:1162247/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:10701/1‑61 (MQ=255) tttGTGGAATATGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCa  >  1:2152274/1‑61 (MQ=255)                                                             | TTTGTGGAATTTGACCCAGAAGTGATTCATACCACGACTATCAACGCGACCCGCGGTGTCA  >  W3110S.gb/3612025‑3612085

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑