Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3679443	3679445	3	24 [0]	[0] 14	ilvY	DNA‑binding transcriptional dual regulator

CTGCCCGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTTTATT  >  W3110S.gb/3679382‑3679442                                                             | ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:2887463/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:878133/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:751713/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:551995/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:350007/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:339948/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:331185/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:306690/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:2923779/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:2923033/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:290182/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:100485/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:2779156/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:2529493/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:2503927/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:2490217/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:1963224/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:1933093/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:1921543/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:1338178/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:110739/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:1061313/61‑1 (MQ=255) ctgcccGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:1055336/61‑1 (MQ=255)                tCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTttatt  <  1:643340/46‑1 (MQ=255)                                                             | CTGCCCGGTGCGTAATCAGGTGTCGGTAGAGAAGCCGGACTGGTCAACGGTGCCGTTTATT  >  W3110S.gb/3679382‑3679442

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑