Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3720296	3720300	5	31 [0]	[0] 28	atpD	F1 sector of membrane‑bound ATP synthase, beta subunit

GCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTGG  >  W3110S.gb/3720235‑3720295                                                             | gCAACCACCTTTGCGCACCTTGCCGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:573704/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGGCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:783869/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:2076119/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:998791/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:908086/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:816822/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:63829/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:591034/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:313756/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:2775506/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:2619484/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:2572076/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:2379520/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:2326858/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:2310641/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1106515/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1896261/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:185405/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1836113/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1767462/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1742745/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1741482/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1710120/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1667098/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1662362/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1621072/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:134362/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1318509/61‑1 (MQ=255) gCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1290688/61‑1 (MQ=255)  cAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:1513457/60‑1 (MQ=255)                    ttGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTgg  <  1:2192949/42‑1 (MQ=255)                                                             | GCAACCACCTTTGCGCACCTTGACGCAACCGTGGTACTGAGCCGTCAGATCGCGTCTCTGG  >  W3110S.gb/3720235‑3720295

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑