Missing coverage evidence...
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CTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGA  >  W3110S.gb/170336‑170397                                                              | cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2333887/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:943682/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:835605/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:781735/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:469514/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:37215/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:368154/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:305695/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2915934/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2852951/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2789276/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2523778/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2471131/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2408212/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2363968/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1042707/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2302661/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2194250/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:2067033/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1974301/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1829624/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1763366/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1708908/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1646449/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:157651/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1556918/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1478683/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1396895/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1257093/1‑62 (MQ=255) cTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGa  >  1:1147025/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTGTCGCTGGTGCACCGTTTAAGTCAGGAGCGTGGCCTGACGGTCATTGCCGTGTTGCACGA  >  W3110S.gb/170336‑170397

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑