Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3837152	3837197	46	43 [0]	[0] 8	rfaB	UDP‑D‑galactose:(glucosyl)lipopolysaccharide‑1, 6‑D‑galactosyltransferase

GAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGCC  >  W3110S.gb/3837099‑3837151                                                     | gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:491991/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2300840/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2384913/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2388415/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2723548/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2753769/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2804065/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2925869/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:408003/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:409986/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:478854/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2297959/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:575599/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:600054/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:663992/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:665575/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:688050/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:773988/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:842617/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:888395/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:97413/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1636527/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1068328/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1103945/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1107540/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1204583/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1279831/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1453485/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1553297/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1016287/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1642228/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1645782/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1794749/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1811995/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1823884/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1870013/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2231578/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2277816/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTAGCAGTGCCGATTGTGGCTCCGGGcc  <  1:1358957/53‑1 (MQ=255) gAAGCCTTGTCGTGGGGGATGCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1397119/53‑1 (MQ=255)  aaGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:170913/52‑1 (MQ=255)  aaGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:2727296/52‑1 (MQ=255)                 ggATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGcc  <  1:1352066/37‑1 (MQ=255)                                                     | GAAGCCTTGTCGTGGGGGATTCCTTGTATCAGTGCCGATTGTGTCTCCGGGCC  >  W3110S.gb/3837099‑3837151

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑