Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3843438	3843438	1	8 [0]	[0] 19	rfaL	O‑antigen ligase

AAAAAAAACATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGT  >  W3110S.gb/3843376‑3843437                                                              | aaaaaaaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGt  >  1:101199/1‑62 (MQ=255) aaaaaaaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGt  >  1:2711659/1‑62 (MQ=255)  aaaaaaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGt  <  1:1950201/61‑1 (MQ=255)  aaaaaaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGt  <  1:1970104/61‑1 (MQ=255)  aaaaaaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGt  <  1:2558128/61‑1 (MQ=255)  aaaaaaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGt  <  1:2641386/61‑1 (MQ=255)  aaaaaaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGt  <  1:565905/61‑1 (MQ=255)  aaaaaaaCATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGt  <  1:925000/61‑1 (MQ=255)                                                              | AAAAAAAACATAATATATAAGTTATTATCTCTAAAATCATTGATGATTTCAGAGTGTAAGGT  >  W3110S.gb/3843376‑3843437

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑