Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3874449	3874514	66	16 [0]	[0] 3	rhsA	rhsA element core protein RshA

ACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCT  >  W3110S.gb/3874394‑3874448                                                       | accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:142720/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:1494499/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:1521113/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:1841070/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:1966301/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:2003356/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:2093705/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:2195152/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:2251681/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:2540187/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:2622400/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:688770/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:862996/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:899973/1‑55 (MQ=255) accaTTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:935096/1‑55 (MQ=255) accaATTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCt  >  1:89839/1‑55 (MQ=255)                                                       | ACCATTTTGTCAATGCTTTTGCAGCATTATCATCTGCTTGCTGCTGTGCAGGGCT  >  W3110S.gb/3874394‑3874448

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑