Missing coverage evidence...
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CACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCGTTT  >  W3110S.gb/3900917‑3900978                                                              | cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:749530/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:2796150/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:2881289/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:419728/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:491334/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:574551/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:661918/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:69362/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:720491/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:2745919/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:775244/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:875589/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:877330/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:922073/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:925033/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:932190/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:957122/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:96899/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1871058/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1167896/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1392353/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1635666/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1711031/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1734106/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1741257/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1796907/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1871048/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1018055/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1886686/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:1900912/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:2297033/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:2322985/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:2408104/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:2514971/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:2527648/1‑62 (MQ=255) cACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCgttt  >  1:269423/1‑62 (MQ=255)                                                              | CACTTTATCGTCGCCATGCTCACGAACAAAGCCGTAGCCCTGCTTCAGCAAAAGTGTCGTTT  >  W3110S.gb/3900917‑3900978

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑