Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	3970828	3970882	55	30 [0]	[0] 6	treF/yhjA	cytoplasmic trehalase/predicted cytochrome C peroxidase

GAGATCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATAA  >  W3110S.gb/3970766‑3970827                                                              | gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCTTaa  <  1:1637674/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2438243/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:962966/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:943131/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:906942/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:831317/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:582825/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:530074/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:473160/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:306539/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2856099/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2738264/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2692546/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:1114552/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2179402/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2154710/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2072825/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2067951/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:1609519/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:141485/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:1400918/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:1398008/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:1341346/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:1156236/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:1153426/62‑1 (MQ=255) gagaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:1136787/62‑1 (MQ=255)  agaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2354796/61‑1 (MQ=255)  agaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2669662/61‑1 (MQ=255)  agaTCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATCAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:505935/61‑1 (MQ=255)                  tcaGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATaa  <  1:2573225/45‑1 (MQ=255)                                                              | GAGATCGACTTCGATCATCAGTTCGTCTGGATTAGGGTTTTGAATTTTCTGATTGAGCATAA  >  W3110S.gb/3970766‑3970827

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑