Missing coverage evidence...
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TCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCG  >  W3110S.gb/4028635‑4028696                                                              | tCAGCACGTTGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:479014/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2466923/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:668489/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:608121/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:487307/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:420524/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:417/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:407974/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2769550/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2734344/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2705940/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2664665/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2590461/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2552904/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2538074/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1067354/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2363545/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2280227/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2152328/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2130090/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2013796/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1963597/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:193637/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1873573/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1861911/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1704596/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1666591/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1441547/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1278684/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1259666/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTCTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:401702/62‑1 (MQ=255) tCAGCACGAGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:2527524/62‑1 (MQ=255)     cACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCg  <  1:1130418/58‑1 (MQ=255)                                                              | TCAGCACGTGGTAAAAATGAAACACTGTTGTAAAAATGTGGTGATCCTCATGCCCGAACCCG  >  W3110S.gb/4028635‑4028696

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑