Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4063065	4063066	2	31 [0]	[0] 2	gntK	gluconate kinase 2

ACGATCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACTAAT  >  W3110S.gb/4063003‑4063064                                                              | acgaTCGCAAGCCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:194757/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCTGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2570111/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCTCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:1277209/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2345724/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:996103/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:979700/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:901984/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:891896/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:774742/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:625593/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:53608/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:292095/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2907659/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2840337/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2699302/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2456363/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:1029831/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2265160/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2233903/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2185381/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2096131/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2039253/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:1902765/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:1888004/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:1659161/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:1474814/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:1422505/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:1159048/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:103921/62‑1 (MQ=255) acgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGACGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:2528445/62‑1 (MQ=255)  cgaTCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACtaat  <  1:467854/61‑1 (MQ=255)                                                              | ACGATCGCAAACCGTGGTTGCAGGCGCTGAACGACGCCGCGTTTGCTATGCAGCGCACTAAT  >  W3110S.gb/4063003‑4063064

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑