Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 4079961 4080102 142 30 [0] [0] 11 glpR DNA‑binding transcriptional repressor

TCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCT  >  W3110S.gb/4079903‑4079960
                                                         |
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1986279/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:887473/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:771230/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:768543/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:767866/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:705765/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:505426/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:2636068/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:2599218/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:2572957/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:2541755/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:2335236/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:2058928/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1002043/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1968837/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1927933/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1907300/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1825625/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:176907/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:161382/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1567677/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:149902/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1491833/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1386687/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1283543/58‑1 (MQ=255)
tCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1134036/58‑1 (MQ=255)
 cAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1773390/57‑1 (MQ=255)
    cccGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:1945358/54‑1 (MQ=255)
           aCTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:2391163/47‑1 (MQ=255)
               ttCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCt  <  1:2066941/43‑1 (MQ=255)
                                                         |
TCAGCCCGCAGACTATTCGCCGCGACCTCAATGAGCTGGCGGAGCAAAACCTGATCCT  >  W3110S.gb/4079903‑4079960

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: