Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4082054	4082060	7	22 [0]	[0] 4	rtcR	sigma 54‑dependent transcriptional regulator of rtcBA expression

GCGCGAGCGGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATA  >  W3110S.gb/4081992‑4082053                                                              | gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:2219389/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:853195/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:441171/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:2926704/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:277989/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:2777504/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:2742648/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:223447/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:1072199/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:2068626/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:2005659/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:1836206/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:1721741/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:163281/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:1156179/62‑1 (MQ=255) gcgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:1128057/62‑1 (MQ=255)  cgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:1877565/61‑1 (MQ=255)  cgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:2529835/61‑1 (MQ=255)  cgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:1693297/61‑1 (MQ=255)  cgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:1227636/61‑1 (MQ=255)  cgcgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:531031/61‑1 (MQ=255)    cgagcgGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATa  <  1:2698358/59‑1 (MQ=255)                                                              | GCGCGAGCGGGCGTCGTGCAACAATTCCAGTCGATCGATGACCAACGATTCTTGCTGGCATA  >  W3110S.gb/4081992‑4082053

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑