Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4124414	4124445	32	24 [0]	[0] 34	damX/dam	hypothetical protein/DNA adenine methylase

ACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTCCC  >  W3110S.gb/4124352‑4124413                                                              | acgcGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:77385/59‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCTTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1018537/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:2316809/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:814378/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:769054/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:603538/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:306192/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:2926270/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:2880211/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:2681052/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:2618165/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:2510467/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:237711/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:2143041/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:2006969/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1887784/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1613260/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1360151/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1269332/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1200612/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1153019/62‑1 (MQ=255) aCCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1044040/62‑1 (MQ=255)  cccGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1223939/61‑1 (MQ=255)                         aGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTccc  <  1:1511500/38‑1 (MQ=255)                                                              | ACCCGTGGGCGAAACCGCTGCGTCAGGTACAGGCCGATCTGAAGTAATCAAGGTTATCTCCC  >  W3110S.gb/4124352‑4124413

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑