Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	4177335	4177357	23	38 [0]	[0] 14	gspK	general secretory pathway component, cryptic

CGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCG  >  W3110S.gb/4177273‑4177334                                                              | cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:35082/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1147852/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:225847/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2268674/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2291273/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2341810/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2572677/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2663382/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2796997/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2871883/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2232959/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:375583/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:433175/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:569040/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:686946/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:762244/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:914389/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:918538/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:958147/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2156643/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1230556/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1337729/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1353718/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1355775/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1380391/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1386681/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1391114/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1471447/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1491779/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:166433/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1700168/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1813817/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1985219/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2125725/62‑1 (MQ=255) cGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:216406/62‑1 (MQ=255)  gTGGTCTGTCTGTCTTTATCTTTATCGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:2037454/61‑1 (MQ=255)          tctgtcGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:1487294/53‑1 (MQ=255)               cGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCg  <  1:778144/48‑1 (MQ=255)                                                              | CGTGGTCTGTCTGTCGTTATCTTTAACGTCCTGGGTGAGGCTGGCAAGCGCAAGTTTCTCCG  >  W3110S.gb/4177273‑4177334

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑