Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4377580	4377583	4	26 [0]	[0] 22	yjeI	conserved hypothetical protein

TGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCA  >  W3110S.gb/4377517‑4377579                                                               | tGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATT‑AGTGCTGCCGGTCa  <  1:1905215/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATTGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:210336/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGGGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1903572/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCTGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:439666/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:2019932/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:839205/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:431424/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:2759552/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:2754412/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:2691472/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:257942/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:2577714/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:2216797/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1000847/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1731784/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1587403/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1459049/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1342121/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1338500/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1291818/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1233751/62‑1 (MQ=255)  gTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTACAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:124764/62‑1 (MQ=255)   tCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1906055/61‑1 (MQ=255)   tCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:2571744/61‑1 (MQ=255)   tCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:710204/61‑1 (MQ=255)   tCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCa  <  1:1042102/61‑1 (MQ=255)                                                               | TGTCGGTGCCGCGCTACTGATGGCGGGTTGTAGCTCCAGCAACGAATTGAGTGCTGCCGGTCA  >  W3110S.gb/4377517‑4377579

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑