Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4462456	4462536	81	33 [0]	[0] 33	yjgA	conserved hypothetical protein

TCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAATT  >  W3110S.gb/4462405‑4462455                                                   | tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:361212/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2410468/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2432373/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2457180/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2511138/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2639939/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2839850/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:290538/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:32193/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2277876/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:372208/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:416283/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:564166/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:604084/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:753496/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:82829/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:920444/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:1009250/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2251672/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2124372/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2067993/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:2021426/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:1826348/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:1810451/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:178780/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:1675912/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:163480/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:1435393/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:1432458/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:137078/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:1196635/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:1140305/51‑1 (MQ=255) tCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAAtt  <  1:104117/51‑1 (MQ=255)                                                   | TCAACAATTTCCGCGCCAAGGCGTTTTAGCTCCTCGGCATCACGTTTAATT  >  W3110S.gb/4462405‑4462455

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑