Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4564439	4564454	16	9 [0]	[0] 31	yjiG	conserved inner membrane protein

ACGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTG  >  W3110S.gb/4564378‑4564438                                                             | aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:1008626/61‑1 (MQ=255) aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:1112371/61‑1 (MQ=255) aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:115488/61‑1 (MQ=255) aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:1202924/61‑1 (MQ=255) aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:1896381/61‑1 (MQ=255) aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:1897426/61‑1 (MQ=255) aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:1995820/61‑1 (MQ=255) aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:2686171/61‑1 (MQ=255) aCGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTg  <  1:80510/61‑1 (MQ=255)                                                             | ACGGTGACATCGTGACCGGTTAATGCGCCAGCGGTTGCCAGACTGGCGGCAACACCGACTG  >  W3110S.gb/4564378‑4564438

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑