Missing coverage evidence...
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TTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTT  >  W3110S.gb/4576160‑4576219                                                            | ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2750213/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2299202/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2328785/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2340522/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2430238/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:243960/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2469267/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2637555/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2711411/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2718023/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2748349/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2137962/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:29088/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:347415/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:35317/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:365553/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:376311/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:377310/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:722128/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:772037/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:84915/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:962615/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2115673/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1147922/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1155603/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1168181/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1184606/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1203923/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1215578/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1231832/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1256863/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1404380/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1512231/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1672072/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1796772/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:186510/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1911528/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:209262/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2115485/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1006656/60‑1 (MQ=255) ttAAGCTGCGCACCGACAGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:2107901/60‑1 (MQ=255)  tAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1431849/59‑1 (MQ=255)        gcgcACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGtt  <  1:1301606/53‑1 (MQ=255)                                                            | TTAAGCTGCGCACCGACGGCAATTTCTCCCCGTGACGATACAGCCCTTGCTCAATCCGTT  >  W3110S.gb/4576160‑4576219

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑