Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ W3110S.gb 249622 249648 27 27 [0] [0] 30 fhiA ECK0230:JW5811:b0229; flagellar system protein, promoterless fragment

CCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA  >  W3110S.gb/249560‑249621
                                                             |
ccAGCACGAACATAATCCGGGTGGCGGTGTAGAGCAGCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2725385/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2127665/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:774179/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:68040/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:641720/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:615541/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2904320/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:271989/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2706106/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2684542/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2648824/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2646352/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:258934/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2212678/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:114131/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:2089779/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:199609/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1995950/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:198036/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1873742/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1835473/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1730298/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1706006/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1494475/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1480993/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1267392/62‑1 (MQ=255)
ccAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTa  <  1:1159474/62‑1 (MQ=255)
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CCAGCACGAACATAATCCCGGTGGCGGTGTAGAGCACCGACGGGCTTGCCAGCAGCTGGTTA  >  W3110S.gb/249560‑249621

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: