Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	4616233	4616310	78	37 [0]	[1] 29	osmY	periplasmic protein

GCGCAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAA  >  W3110S.gb/4616171‑4616232                                                              | gcgtAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:779090/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2826439/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1017410/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2314763/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2337077/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2474459/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2521010/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:269195/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2709486/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2718712/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2245950/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:37224/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:408141/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:707989/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:734540/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:771516/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:803752/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:972039/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1705107/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1088988/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1174019/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1242584/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1399283/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:142968/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1437053/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1445443/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1556839/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2087217/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1722957/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1786718/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1794972/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:186738/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1873270/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:1962135/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2004129/62‑1 (MQ=255) gcgcAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGAAAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:513807/62‑1 (MQ=255)    cAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTaa  <  1:2340324/59‑1 (MQ=255)                                                              | GCGCAGACTACCAATGAAAGCGCAGGGCAAAAAGTCGATAGCTCTATGAATAAAGTCGGTAA  >  W3110S.gb/4616171‑4616232

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑