Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	296502	296516	15	14 [0]	[0] 23	intF/yagP	predicted phage integrase/predicted transcriptional regulator

ATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCAT  >  W3110S.gb/296440‑296501                                                              | aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:1140686/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:1397263/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:197080/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:2252085/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:2423825/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:2464070/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:2686891/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:2837024/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:452283/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:576655/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:606600/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:757611/62‑1 (MQ=255) aTGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:805115/62‑1 (MQ=255)   gCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCat  <  1:1641349/60‑1 (MQ=255)                                                              | ATGCGAAGGTCGTAGGTTCGACTCCTATTATCGGCACCATTAAAATCAAAGAGTTACCCCAT  >  W3110S.gb/296440‑296501

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑