Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	400176	400225	50	33 [0]	[0] 11	ddlA/yaiB	D‑alanine‑D‑alanine ligase A/hypothetical protein

ACCAAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACAAA  >  W3110S.gb/400115‑400175                                                             | accaAAACCGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1315258/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2090336/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:883535/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:764659/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:700189/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:474383/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:42897/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2832397/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2773479/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2572215/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2485881/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2434348/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:214601/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2141630/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1078883/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1896754/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1094692/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1114216/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1122679/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1219045/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1280692/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1316167/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1504016/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1532175/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1640204/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1668554/61‑1 (MQ=255) accaAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2045955/61‑1 (MQ=255)                  cccGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:863724/44‑1 (MQ=255)                    cGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:330180/42‑1 (MQ=255)                      cAGTTTTTCGATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:399100/40‑1 (MQ=255)                         tttttCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1279425/37‑1 (MQ=255)                          ttttCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:2381945/36‑1 (MQ=255)                           tttCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACaaa  <  1:1279223/35‑1 (MQ=255)                                                             | ACCAAAAACGATTCCTACCCGCAGTTTTTCCATCTTAAAAACCTATCCCGTCTAACACAAA  >  W3110S.gb/400115‑400175

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑