Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	417682	417701	20	11 [0]	[0] 5	phoR	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with PhoB

CACCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGATGGT  >  W3110S.gb/417622‑417681                                                            | cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:1071525/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:1190587/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:1193256/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:1685394/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:2479727/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:2729892/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:2892389/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:408844/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:530661/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:624945/60‑1 (MQ=255) cacCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGAtggt  <  1:868570/60‑1 (MQ=255)                                                            | CACCGGGCGGCATCTGGAAATTCGCGTCATGCCTTATACCCACAAACAGTTGCTGATGGT  >  W3110S.gb/417622‑417681

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑