Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	488931	488984	54	18 [0]	[0] 12	kefA	fused mechanosensitive channel proteins

TTCTTTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAT  >  W3110S.gb/488880‑488930                                                   | ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:272114/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:983766/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:981625/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:963339/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:736248/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:540326/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:2762800/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:1082636/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:2465733/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:2261227/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:1778326/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:1716276/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:1333725/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:1198351/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:1181688/51‑1 (MQ=255) ttcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:1165004/51‑1 (MQ=255)  tcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:2883619/50‑1 (MQ=255)  tcttTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAt  <  1:874226/50‑1 (MQ=255)                                                   | TTCTTTACGGCATTTGGTGCCAGCACGTTGGATCATGAGCTGCGTCTGTAT  >  W3110S.gb/488880‑488930

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑