Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	538766	538775	10	40 [0]	[0] 12	allB	allantoinase

GCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGA  >  W3110S.gb/538704‑538765                                                              | gCTAAAGGCAAGCTGACTTTTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2266493/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2626166/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2066113/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2077/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1138735/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2167350/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2336335/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2349451/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2457017/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2160455/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2718203/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2787839/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2799575/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:383243/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:479306/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:496353/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:762852/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:98036/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2035651/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1166343/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1351317/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1396199/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1501612/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1633743/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1663079/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1680983/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1808245/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1946503/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1999587/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2017353/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2021979/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2033616/62‑1 (MQ=255) gCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2053519/62‑1 (MQ=255)  cTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2578473/61‑1 (MQ=255)  cTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2670092/61‑1 (MQ=255)  cTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:2695612/61‑1 (MQ=255)  cTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:363464/61‑1 (MQ=255)  cTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1374522/61‑1 (MQ=255)  cTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:774855/61‑1 (MQ=255)              tGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGa  <  1:1895219/49‑1 (MQ=255)                                                              | GCTAAAGGCAAGCTGACTATTGATGCGGCACAACTCGGTGGCCTGGTGTCTTACAACATCGA  >  W3110S.gb/538704‑538765

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑