Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	559638	559642	5	24 [0]	[0] 29	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

CTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGC  >  W3110S.gb/559576‑559637                                                              | cTATTTTCGCGGATATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:88033/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2625308/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:953848/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:496988/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:453614/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:439815/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:438133/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:393902/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2802793/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2644927/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2644007/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:1088078/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2613922/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:258443/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2492773/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2244742/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2193020/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2106653/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:1577070/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:1243560/62‑1 (MQ=255) cTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:1135470/62‑1 (MQ=255)  tATTTTCGCGGAAATTGATATCATTCAGAACACTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:1890800/61‑1 (MQ=255)  tATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:2870903/61‑1 (MQ=255)                  gATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAgc  <  1:1416484/45‑1 (MQ=255)                                                              | CTATTTTCGCGGAAATGGATATCATTCAGAACAGTGGAATAATATTGGCACCTGGGTACAGC  >  W3110S.gb/559576‑559637

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑