Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	560842	560861	20	10 [1]	[0] 25	sfmD	predicted outer membrane export usher protein

AGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCC  >  W3110S.gb/560780‑560843                                                              |   aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAg    <  1:165747/62‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAg    <  1:1746811/62‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAg    <  1:2181393/62‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAg    <  1:2310184/62‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAg    <  1:2360771/62‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAg    <  1:2375842/62‑1 (MQ=255) aGCTGGCTGGCAGGGGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAg    <  1:1960026/62‑1 (MQ=255)    tggctggcAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGcc  <  1:2539137/61‑1 (MQ=255)        tggcAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCAGGTAAg    <  1:673777/55‑1 (MQ=255)         ggcAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAg    <  1:1938457/54‑1 (MQ=255)                                                              |   AGCTGGCTGGCAGGTGTAGGTGGGACCTTACTGGAAGGCCACAACCTGAGTTATCACGTAAGCC  >  W3110S.gb/560780‑560843

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑