Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	562296	562362	67	37 [0]	[1] 31	sfmH	predicted fimbrial‑like adhesin protein

AAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCG  >  W3110S.gb/562235‑562295                                                             | aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:444723/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2288536/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2367329/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2399734/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2635031/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2726295/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2778373/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2814226/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2897313/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:371828/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2194980/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:455483/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:515263/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:552977/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:557745/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:563287/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:761833/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:900588/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:974494/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:165953/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1102434/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1260235/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1281890/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1320129/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1340548/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1342908/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1472858/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1643723/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1054628/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1673211/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1680795/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1947275/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:1985522/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2056115/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2076395/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2164502/1‑61 (MQ=255) aaaCCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCg  >  1:2180211/1‑61 (MQ=255)                                                             | AAACCAAGAGCATTGCGGTCAAATGTACGAATGTTGCTGCGCAGGCTTATTTAACAATGCG  >  W3110S.gb/562235‑562295

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑