Missing coverage evidence...
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*	*	÷	W3110S.gb	773291	773329	39	36 [0]	[0] 25	cydA	cytochrome d terminal oxidase, subunit I

GTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATC  >  W3110S.gb/773229‑773290                                                              | gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGGGAtc  <  1:2128014/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:33764/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1164810/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2413042/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2536393/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2693353/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2721321/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2910310/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:295422/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2328162/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:361973/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:388285/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:499492/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:655459/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:727172/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:746952/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:775385/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:912996/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2200355/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1211459/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1334811/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1457799/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1465150/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1466620/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1765288/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1910808/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2122788/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2241372/62‑1 (MQ=255) gTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGGCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1729660/62‑1 (MQ=255)  tGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1899474/61‑1 (MQ=255)  tGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2119344/61‑1 (MQ=255)  tGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1368297/61‑1 (MQ=255)     gCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:1888597/58‑1 (MQ=255)           ggTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:2467420/52‑1 (MQ=255)                 gTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGAtc  <  1:36895/46‑1 (MQ=255)                  tgctgcCGACAGCTGTGGCTAACTCGTCACTGACGGCAGGCGAtc  <  1:1565772/45‑1 (MQ=255)                                                              | GTGGGCTATCGGTGAAGTGCTGCCGACAGCTGTGGCGAACTCGTCACTGACCGCAGGCGATC  >  W3110S.gb/773229‑773290

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑