Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	970643	970666	24	20 [0]	[0] 14	ycaQ	conserved hypothetical protein

AAATTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCG  >  W3110S.gb/970582‑970642                                                             | aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:2108107/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:889966/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:866621/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:827172/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:433478/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:2433278/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:2351144/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:2334435/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:2219885/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:2122840/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1078391/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:2052613/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1962721/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1939006/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1559425/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1396599/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1350831/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1243597/61‑1 (MQ=255) aaaTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1106675/61‑1 (MQ=255)   aTTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCg  <  1:1654427/59‑1 (MQ=255)                                                             | AAATTGGGCAATCTTTGGCTGCATGATGATTTGCTGCCGCTACTCGAGCGAGCGCTGGCCG  >  W3110S.gb/970582‑970642

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑