Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1076809	1076809	1	63 [0]	[0] 17	putA	fused DNA‑binding transcriptional regulator, proline dehydrogenase, and pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase

AACATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGACC  >  W3110S.gb/1076747‑1076808                                                              | aaCATCAGCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTGAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:203758/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:285145/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2271572/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2276339/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2279032/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2303255/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:242960/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2453810/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2494797/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2502244/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2516810/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2522039/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2676322/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2716212/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2756303/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2847981/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2045102/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2874937/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2898523/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:290879/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2925084/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:314289/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:340014/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:407968/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:483729/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:698200/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:72002/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:766971/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:845091/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:846486/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:933351/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:979533/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1601518/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1074313/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1088032/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1206596/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1229843/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1265804/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1290155/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1343004/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1376755/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1410611/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1435719/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1460961/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1473471/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1488397/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:151170/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1063085/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1608608/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1640997/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1647550/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:165876/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1675026/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1698018/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1714840/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1824033/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1863714/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1888273/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1891995/62‑1 (MQ=255) aaCATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1946970/62‑1 (MQ=255)  aCATCACCCGGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1775287/61‑1 (MQ=255)           cgcgCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:1204065/52‑1 (MQ=255)                          caCCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGAcc  <  1:2465268/37‑1 (MQ=255)                                                              | AACATCACCCCGCGCACGCGATCATCACCCGTCAGTTGCGCGCCCACGGTTTCACCCCGACC  >  W3110S.gb/1076747‑1076808

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑