Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1093880	1093905	26	26 [0]	[0] 29	ycdT	predicted diguanylate cyclase

TGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCA  >  W3110S.gb/1093834‑1093879                                              | tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:2314560/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:840286/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:822964/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:82116/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:680169/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:656823/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:585353/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:571418/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:534637/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:345193/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:2920484/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:2730467/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:2647518/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1199889/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:2303169/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:2273224/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:2160230/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1737319/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1704235/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1695105/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1621720/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1491017/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1485285/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1441957/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1290543/1‑46 (MQ=255) tGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCa  >  1:1226254/1‑46 (MQ=255)                                              | TGCCGAGTTAACCAATGAAAATGGTCAGGTGGTTTGGAAAGCCTCA  >  W3110S.gb/1093834‑1093879

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑