Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	W3110S.gb	1093968	1093968	1	34 [0]	[0] 2	ycdT	predicted diguanylate cyclase

GTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAG  >  W3110S.gb/1093906‑1093967                                                              | gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2081105/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:891972/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:765036/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:640619/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:45184/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:443629/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:357274/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2829911/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2779566/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2627302/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2577116/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2280928/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2277826/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2223220/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1173506/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1998870/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1971212/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1258510/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1285429/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1289645/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:130991/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1358489/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1606122/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1618701/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1626459/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1717385/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1736186/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1978238/62‑1 (MQ=255) gTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCAATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2169730/62‑1 (MQ=255)  ttAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:2336758/61‑1 (MQ=255)  ttAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:752898/61‑1 (MQ=255)  ttAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1233939/61‑1 (MQ=255)                       cTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:176159/40‑1 (MQ=255)                            cTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAg  <  1:1684381/35‑1 (MQ=255)                                                              | GTTAACCTTGCTTTCGGTTAATCTATACTTTAATGGTTTACGCTATGATATCTGGAATGGAG  >  W3110S.gb/1093906‑1093967

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑